为促进两岸农产品贸易发展，2009年12月22日签署的“海峡两岸农产品检疫检验合作协议”历经5年耕耘，成效显着。最新成果是台湾葡萄、山西樱桃今年列入双方互销的水果。2015年6月8～9日两岸有关方面在台湾举办第11次工作会商及第八届两岸农产品检疫检验研讨会，针对双方关切的农产品检疫检验18项议题，包括台湾葡萄、生鲜菇类与犬猫食品输陆申请，争取台湾水果输陆便捷通关与观赏水生动物输陆简化检疫程序，以及双方检疫犬培训技术交流合作等，均获具体成效。

受益于2008年以来两岸“三通”、ECFA（海峡两岸经济合作框架协议）早收清单降税及《海峡两岸农产品检疫检验合作协议》，去年两岸农产品贸易总额达19.6亿美元，相较于协议签署前之9.1亿美元，成长达114%。两岸农产品贸易快速成长，该协议的落实执行实为功不可没。透过协议执行，双方适时解决农产品贸易通关问题并进行检疫检验技术与标准的交流合作，完成台湾稻米、鲜梨、畜禽产品准入，以及山东省樱桃与梨接穗顺利输台等具体成果。

“农委会”表示，该协议具有对双方农产品质量的把关机制，未来除持续深化合作机制并建立农产品快速便捷通关措施外，维护保障两岸民众食的安全亦将是该协议刻不容缓的努力目标。