目前主要的瓜类果斑病害诊断方法包括病征与型态学检测法和利用近代分子生物技术诊断法，在操作速度及简便性、试剂的敏感性与专一性等方面有极大改进空间。大多数方法需要仰赖精密仪器或具备熟练技术门槛的操作员，一般种苗繁殖者常无法自行作业，必须将样本寄送至研究单位进行检测，较为耗时且不符合经济效益。

运用生物技术发展新式分子检测方法，开发分子诊断作物病害是一种新的科技趋势与技术。台湾农业试验所经过多年的努力成功研发出一种西瓜种苗健康检测方法“瓜类果斑病的快速检验技术”，成为种苗品质把关的利器，提升台湾植物种苗产业竞争力。

农试所研发成功的这项新式快速分子诊断技术，使用一种反应温度即可在不同类型感染作物上测试，并能正确鉴别病害类型，判断该检体为阳性或阴性反应，亦可确定检体已带有的病菌种类，若无反应则表示未受感染。该技术灵敏度甚高，除可应用于健康种苗检测外，也可应用于抗病品系株选拔、田间监控或早期潜伏感染植株诊断等，未来将朝向以技术平台提供需要的业界运用。