台湾地区动植物检疫中心鸟类检疫区新落成的设施使用满一年，共为20808只岛外输入的鸟类执行隔离检疫，抽验结果皆阴性，而且作业更便利、感染控管得到强化，使得防疫工作卓有成效。

新启用的鸟类检疫区共有2栋建筑物，一栋是两层楼的禽鸟隔离舍，设有12间鸟类隔离检疫厩舍及1间负压隔离室。鸟类隔离检疫厩舍同时设计成独立消毒作业区，设备简单以利于彻底清洗消毒，还设有独立空调、监视器及防窃、防飞逃、防蚊的3层防护窗，人员入口设有检查站，进出人员都需经过检查，可防止偷窃、掉包检疫物等不法事件发生。

此外，设有管制站，作为人、车及隔离鸟类的进出关口，进出人员都要在此换上干净、可抛弃式鞋套，或是穿上雨鞋踏过消毒池；隔离检疫所需使用的车辆、笼具、鸟类或其他隔离检疫用具都要喷雾消毒才能通过，其他载人的车辆禁止进入、强制消毒检疫。

要输入鸟类的业者还能上网先登录选择隔离厩舍，同时方便兽医等工作人员提早作业准备，有利于执行禽流感、鹦鹉热、新城病、伊波拉等海外恶性重大疾病的防疫，检疫区离机场只要20多分钟车程，一旦检疫出阳性，可尽速扑杀处理。