荧光鱼自2001年首度发表以来，全球各国科学家一直无法突破将小型观赏荧光鱼发展为中型观赏荧光鱼的一些关键技术。台湾中研院、农委会通过基因转殖技术，将十公分以下小型荧光鱼体型“升级”，成功培育出全球第一批中型观赏荧光鱼，象征台湾荧光鱼基因转殖技术独步全球。

在台湾农委会协助下，台湾中研院细胞与个体生物学研究所与台湾最大的观赏鱼业者芝林公司合作，历经三年研究，利用水母绿荧光蛋白质基因及抗菌蛋白基因与起动子相连，构筑质体。第一支殖入改良型肌肉起动子荧光蛋白基因的九间波罗鱼于2008年8月在中央研究院临海研究站诞生，经芝林公司以分子标志辅助育种的技术，将分子标志应用于遗传上的育种及改良，目前已产下第三代，从而为该项转基因观赏鱼成果的产业化奠定了坚实的基础。今年6月台湾行政院农委会宣布成功研发出全球首见的两种中型绿色神仙鱼与九间波罗鱼荧光鱼，在蓝灯下鱼体呈现出漂亮的绿色荧光。

目前芝林公司与中研院正利用鱼类分子标志技术，分析遗传变异和组成，提升荧光观赏鱼育种之速度与效率，使期朝向商业化的量产迈进。